BioLife

Direttore: Dr. Saba Abdulghani

Descrizione

Una piattaforma integrata di ricerca traslazionale

BioLife è la piattaforma di ricerca traslazionale integrata di INOC progettata per collegare campioni biologici e dati clinici provenienti dai pazienti con modelli preclinici avanzati e analisi molecolari.

La piattaforma unisce tre strutture principali: la Biobanca, che raccoglie e conserva i campioni biologici, l’Organoid Unit, dedicata alla creazione di modelli tridimensionali di tessuto a partire dalle cellule dei pazienti, e l’In Vivo Modelling Unit, che sviluppa modelli preclinici per studiare la malattia. Insieme, queste unità permettono di seguire l’intero percorso della ricerca: dalla raccolta dei campioni biologici alla verifica rigorosa dei risultati ottenuti.

BioLife collabora inoltre strettamente con il Genomics Centre, che ne approfondisce l’analisi molecolare, contribuendo così a una ricerca traslazionale sempre più basata sui dati.

Vision

Affermare BioLife come infrastruttura avanzata di ricerca traslazionale, capace di integrare sistematicamente campioni biologici derivati dai pazienti, caratterizzazione molecolare e funzionale e sistemi modello preclinici all’avanguardia, per accelerare la scoperta dei meccanismi biologici, lo sviluppo di biomarcatori e la validazione preclinica delle strategie terapeutiche. Favorendo un’indagine rigorosa e trasversale alle diverse piattaforme e workflow traslazionali basati sui dati, BioLife punta a sostenere lo sviluppo di approcci di oncologia di precisione con elevata fedeltà biologica e rilevanza clinica.

Mission

La mission di BioLife è accelerare la ricerca oncologica e l’oncologia di precisione, collegando campioni biologici derivati dai pazienti, modelli di laboratorio avanzati e tecnologie omiche integrate all’interno di un’unica piattaforma di ricerca traslazionale.

Attraverso questo ecosistema, BioLife sostiene la scoperta, la validazione e lo sviluppo di strategie diagnostiche e terapeutiche più efficaci e personalizzate.

Componenti principali

  • Biobanca: raccolta, trattamento, caratterizzazione e annotazione di campioni biologici derivati dai pazienti
  • Organoid Unit: modelli in vitro derivati dai pazienti per test funzionali e sperimentazione di farmaci
  • In Vivo Modelling Unit: modelli in vivo PDX per validazione preclinica e studi co-clinici

Applicazioni

Aree chiave di applicazione traslazionale e preclinica:

  • Programmi di ricerca traslazionale end-to-end
  • Individuazione e validazione di biomarcatori
  • Sviluppo e sperimentazione preclinica di farmaci
  • Studi co-clinici
  • Ricerca in oncologia di precisione
  • Integrazione di dati multi-omici e funzionali

Opportunità di collaborazione

Modelli disponibili per partnership e collaborazioni di ricerca:

  • Accesso alla piattaforma integrata per partner accademici e industriali
  • Progettazione ed esecuzione di programmi di ricerca traslazionale
  • Combinazione di sistemi modello in vitro e in vivo
  • Sviluppo di progetti basati su approcci multi-omici e data-driven
  • Partnership strategiche di lungo termine

Contatti

Direttrice
Saba Abdulghani, PhD
saba.abdulghani@inoc.it

Biobanca

Campioni biologici dei pazienti e dati clinici associati

La Biobanca rappresenta una infrastruttura strategica per la ricerca traslazionale, dedicata alla raccolta, alla processazione e alla conservazione di campioni biologici di alta qualità insieme ai relativi dati clinici. La disponibilità di materiale biologico accuratamente caratterizzato consente lo sviluppo e la validazione di nuovi biomarcatori, strumenti diagnostici e di terapie di precisione, pensate sulle caratteristiche specifiche di ogni paziente.

La Biobanca è il pilastro principale di BioLife ed è pienamente integrata in un ecosistema oncologico completo. Collega in modo continuo la pratica clinica, l’anatomia patologica, l’analisi molecolare e i modelli di laboratorio avanzati, trasformando i campioni provenienti dai pazienti in risorse affidabili e pronte per essere utilizzate nella ricerca.

Grazie a standard di qualità rigorosi, conformi alla norma internazionale ISO 20387, a una tracciabilità completa di ogni campione e a una gestione integrata dei dati, la Biobanca sostiene collaborazioni di grande impatto con università, enti di ricerca e partner sanitari e industriali, contribuendo ad accelerare il percorso della ricerca, dalla scoperta scientifica fino all’applicazione clinica.

Servizi

Principali attività:

  • Raccolta, trattamento, caratterizzazione e conservazione a lungo termine di campioni biologici derivati dai pazienti
  • Crioconservazione di organoidi, cellule primarie e altri derivati biologici
  • Estrazione di DNA/RNA con controllo di qualità standardizzato
  • Integrazione con dati clinici, patologici e molecolari
  • Supporto alla ricerca traslazionale, all’individuazione di biomarcatori e a progetti finanziati dall’UE

Portfolio di campioni biologici

Materiali biologici disponibili:

  • Resezioni tumorali, tessuti sani corrispondenti e biopsie
  • Campioni fresh-frozen, FFPE e inclusi in OCT
  • Sangue intero, plasma, siero, PBMC e prelievi ematici longitudinali di follow-up
  • Urine, saliva e feci
  • Modelli derivati dai pazienti: organoidi, colture cellulari primarie e altri derivati biologici
  • Tessuti e campioni biologici da xenotrapianti derivati dai pazienti (PDX)

Dati clinici associati

  • Annotazioni cliniche e clinicopatologiche
  • Dati demografici del paziente, diagnosi, stadiazione e storia terapeutica
  • Risposta terapeutica e follow-up clinico longitudinale
  • Revisione istopatologica standardizzata e annotazioni correlate
  • Metadati completi sulla fase pre-analitica e sulla qualità dei campioni
  • Dati molecolari, genomici e multi-omici (quando disponibili)

Opportunità di collaborazione

  • Accesso a campioni biologici di alta qualità e clinicamente annotati, attraverso modelli di collaborazione personalizzati
  • Supporto end-to-end a programmi di R&D accademici, biotech e farmaceutici
  • Integrazione con le strutture di multi-omica, organoidi e PDX
  • Co-sviluppo di biomarcatori e test diagnostici companion
  • Raccolta prospettica e studi longitudinali

Test diagnostici complementari

Aree chiave di applicazione traslazionale e preclinica:

  • Individuazione e validazione di biomarcatori
  • Profilazione molecolare completa dei tumori umani
  • Biopsia liquida per il monitoraggio della malattia e la valutazione della risposta al trattamento
  • Studi clinici retrospettivi, prospettici e multicentrici
  • Ricerca traslazionale e co-clinica
  • Medicina di precisione e test diagnostici companion

Contatti

Responsabile
Eugenia R. Zanella, PhD
eugenia.zanella@inoc.it

Organoid Unit

Organoidi derivati dai pazienti per la ricerca oncologica traslazionale

L’Organoid Unit si occupa della derivazione, dell’espansione, della caratterizzazione funzionale e dell’utilizzo sperimentale di piccoli modelli tridimensionali di tessuto ricavati dalle cellule dei pazienti (organoidi) derivati da pazienti. I campioni provengono da pazienti in cura presso INOC – Istituto Nazionale Oncologico Candiolo o da centri esterni. Integrata nella piattaforma BioLife, l’unità è strettamente collegata alla Biobanca, al Genomics Centre e all’In Vivo Modelling Unit.
Gli organoidi riproducono in laboratorio le caratteristiche biologiche del tumore di partenza, offrendo così modelli di studio realistici e specifici per ogni paziente. Combinando sistemi avanzati di coltura 3D, test funzionali e analisi digitale dei dati, il centro supporta la ricerca oncologica traslazionale, l’individuazione di biomarcatori e lo sviluppo di strategie di medicina di precisione.
L’Organoid Unit è progettata in modo modulare e flessibile, per consentire in futuro un’espansione graduale verso la coltura automatizzata degli organoidi e lo screening fenotipico ad alto contenuto.

Servizi

Funzioni principali:

  • Derivazione di organoidi da campioni clinici e modelli preclinici
  • Sviluppo e applicazione di protocolli standardizzati per sistemi avanzati di coltura 3D
  • Espansione e mantenimento a lungo termine delle collezioni di organoidi
  • Crioconservazione dei modelli organoidi
  • Procedure sistematiche di controllo qualità per garantire la fedeltà genetica ai campioni originali e colture prive di patogeni
  • Sistema centralizzato di gestione dei dati che assicura la piena tracciabilità dei campioni
  • Profilazione molecolare dei modelli organoidi
  • Test mirati di risposta farmacologica sugli organoidi

Applicazioni

Aree chiave di applicazione traslazionale e preclinica:

  • Identificazione e validazione di target terapeutici
  • Screening farmacologico e test di sensibilità
  • Individuazione e validazione di biomarcatori
  • Studio dei meccanismi di resistenza
  • Ricerca in oncologia di precisione
  • Supporto a studi di oncologia di precisione funzionale
  • Valutazione preclinica di terapie mirate e in combinazione

Tipologie di campioni supportate

Materiali biologici compatibili con l’unità:

  • Organoidi derivati dai pazienti (PDO) (già disponibili)
  • Organoidi derivati da xenotrapianti derivati dai pazienti (organoidi PDX-derived) (già disponibili)
  • Sistemi avanzati di coltura 3D (in arrivo)
  • Modelli di co-coltura tumore-stroma e immunitaria (in arrivo)
  • Sistemi avanzati di coltura 3D e co-coltura (pianificati)

Collezione

Tipologie tumorali di interesse, clinicamente annotate:

  • Cancro del colon-retto
  • Cancro gastrico
  • Cancro al seno
  • Cancro alla prostata
  • Cancro ovarico
  • Cancro al pancreas
  • Melanoma
  • Cancro al polmone

Opportunità di collaborazione

Modelli disponibili per partnership e collaborazioni di ricerca:

  • Test farmacologici e saggi funzionali su modelli organoidi
  • Supporto a programmi di ricerca traslazionale e preclinica
  • Integrazione con dataset genomici e multi-omici
  • Co-sviluppo di modelli organoidi e relativi workflow

Contatti

Responsabile
Simonetta Leto, PhD
simonetta.leto@inoc.it

In Vivo Modelling Unit

Validazione preclinica per la ricerca oncologica traslazionale

L’In Vivo Modelling Unit è una struttura preclinica all’avanguardia (1.000 m²) all’interno della piattaforma di ricerca traslazionale BioLife, creata per supportare la ricerca oncologica traslazionale.
La struttura è specializzata nella creazione e nell’applicazione di modelli in vivo derivati da pazienti, in particolare PDX, operando secondo elevati standard microbiologici, con piena tracciabilità e nel pieno rispetto delle normative.

A INOC comprendiamo e condividiamo le preoccupazioni sul benessere e diritti degli animali. Teniamo in grande considerazione queste tematiche e apprezziamo sinceramente i punti di vista di chi mette in discussione o contesta l’uso degli animali nella ricerca. Riteniamo che queste discussioni siano importanti e continuiamo a partecipare con attenzione al più ampio dibattito sociale su questo tema, rispettando ogni punto di vista

Il nostro impegno per l’eccellenza scientifica va di pari passo con la nostra responsabilità di trattare gli animali con cura e rispetto. Ci atteniamo a rigorosi standard etici e legali e ci impegniamo costantemente per migliorare. Questo significa applicare una rigorosa politica interna basata sul principio delle 3R: Replace, Reduce, Refine (Sostituire, Ridurre, Perfezionare). In pratica, questo significa che ci impegniamo al massimo per ridurre al minimo il numero di esperimenti sugli animali, usiamo solo il numero di animali davvero necessario per ottenere risultati significativi e adottiamo ogni misura possibile per ridurre qualsiasi disagio o stress che potrebbero provare. A INOC, la nostra ricerca coinvolge solo topi da laboratorio. La ricerca sugli animali non è mai il nostro approccio predefinito ma vi ricorriamo solo quando non esistono alternative valide per rispondere a questioni scientifiche fondamentali. Il nostro obiettivo è sempre quello di trovare un equilibrio tra il progresso scientifico, la compassione e il rispetto per gli esseri viventi coinvolti.

Servizi

Funzioni principali della piattaforma:

  • Studi preclinici in vivo (efficacia e proof-of-concept), con supporto opzionale PK/PD tramite Charles River
  • Sviluppo di PDX specifici per progetto e biobanking
  • Espansione in vivo di modelli già stabiliti
  • Allevamento interno di ceppi murini immunocompromessi (NOD-SCID)
  • Sviluppo di SOP personalizzate e workflow con controllo di qualità
  • Gestione dati end-to-end tramite LIMS integrato

Tipologie di campioni supportate

Materiali biologici compatibili con la piattaforma:

  • Tessuti tumorali derivati dalla biobanca
  • Campioni freschi di tumore del paziente
  • Frammenti tumorali impiantabili
  • Campioni di sangue/tessuto per analisi in vivo

 

Applicazioni

Aree chiave di applicazione traslazionale e preclinica:

  • Studi preclinici di efficacia farmacologica e proof-of-concept
  • Validazione traslazionale di target terapeutici
  • Studi preclinici di oncologia basati su modelli PDX
  • Definizione del disegno di studi co-clinici
  • Validazione in vivo guidata da biomarcatori

 

Competenze

Competenza consolidata nello sviluppo di modelli PDX, con attività risalenti al 2008 e primi risultati scientifici pubblicati a partire dal 2011.

  • Impegno verso i principi delle 3R (Sostituzione, Riduzione, Perfezionamento) e verso il benessere animale, pienamente integrato nella progettazione ed esecuzione degli studi, in conformità con gli standard normativi
  • Chirurgia sperimentale e monitoraggio in vivo
  • Gestione di linee murine immunocompromesse
  • Gestione avanzata di colonie e allevamento
  • Workflow integrati dal campione al modello, in collaborazione con la Biobanca

Opportunità di collaborazione

Modelli disponibili per partnership e collaborazioni di ricerca:

  • Studi preclinici in vivo per partner accademici e industriali
  • Sviluppo di modelli PDX e programmi di co-sviluppo
  • Collaborazioni strategiche di lungo termine con accesso dedicato alla struttura
  • Integrazione con Biobanca, Organoid Centre e piattaforme di Genomics
  • Programmi di ricerca co-clinica e traslazionale

Contatti

Responsabile
Massenzio Fornasier, PhD
massenzio.fornasier@inoc.it